MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT77

Total Repeats: 1558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020239	T	6	6	118	123	0 %	100 %	0 %	0 %	449092564
2	NC_020239	CTT	2	6	135	140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092564
3	NC_020239	ATA	2	6	239	244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092564
4	NC_020239	TTTCAT	2	12	252	263	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	449092564
5	NC_020239	TCA	2	6	272	277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092564
6	NC_020239	AT	3	6	300	305	50 %	50 %	0 %	0 %	449092564
7	NC_020239	GTAT	2	8	910	917	25 %	50 %	25 %	0 %	449092565
8	NC_020239	A	6	6	978	983	100 %	0 %	0 %	0 %	449092565
9	NC_020239	ATAA	2	8	1008	1015	75 %	25 %	0 %	0 %	449092565
10	NC_020239	A	6	6	1094	1099	100 %	0 %	0 %	0 %	449092565
11	NC_020239	TCT	2	6	1168	1173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092565
12	NC_020239	TGA	2	6	1283	1288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092565
13	NC_020239	GAAA	2	8	1367	1374	75 %	0 %	25 %	0 %	449092565
14	NC_020239	TGG	2	6	1526	1531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092565
15	NC_020239	ATA	2	6	1555	1560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092565
16	NC_020239	GAACA	2	10	1585	1594	60 %	0 %	20 %	20 %	449092565
17	NC_020239	GAA	2	6	1755	1760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092565
18	NC_020239	TCA	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092565
19	NC_020239	AT	3	6	2025	2030	50 %	50 %	0 %	0 %	449092565
20	NC_020239	ACA	2	6	2057	2062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092565
21	NC_020239	AGA	2	6	2093	2098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092565
22	NC_020239	A	6	6	2106	2111	100 %	0 %	0 %	0 %	449092565
23	NC_020239	TA	3	6	2188	2193	50 %	50 %	0 %	0 %	449092565
24	NC_020239	GAA	2	6	2199	2204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092565
25	NC_020239	CAA	2	6	2212	2217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092566
26	NC_020239	AAC	2	6	2220	2225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092566
27	NC_020239	TTAAAA	2	12	2239	2250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092566
28	NC_020239	TAA	2	6	2292	2297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092566
29	NC_020239	ATTC	2	8	2368	2375	25 %	50 %	0 %	25 %	449092566
30	NC_020239	TTCAA	2	10	2516	2525	40 %	40 %	0 %	20 %	449092567
31	NC_020239	GAA	2	6	2583	2588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092567
32	NC_020239	GTCA	2	8	2664	2671	25 %	25 %	25 %	25 %	449092567
33	NC_020239	TC	3	6	2688	2693	0 %	50 %	0 %	50 %	449092567
34	NC_020239	CGC	2	6	2717	2722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449092567
35	NC_020239	A	6	6	2769	2774	100 %	0 %	0 %	0 %	449092567
36	NC_020239	AT	3	6	2792	2797	50 %	50 %	0 %	0 %	449092567
37	NC_020239	T	6	6	2797	2802	0 %	100 %	0 %	0 %	449092567
38	NC_020239	GCA	2	6	2850	2855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449092567
39	NC_020239	CGA	2	6	2890	2895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449092567
40	NC_020239	GGT	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092567
41	NC_020239	AGGT	2	8	3016	3023	25 %	25 %	50 %	0 %	449092567
42	NC_020239	A	6	6	3029	3034	100 %	0 %	0 %	0 %	449092567
43	NC_020239	TA	3	6	3156	3161	50 %	50 %	0 %	0 %	449092567
44	NC_020239	A	6	6	3234	3239	100 %	0 %	0 %	0 %	449092567
45	NC_020239	ATT	2	6	3341	3346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092567
46	NC_020239	A	7	7	3398	3404	100 %	0 %	0 %	0 %	449092567
47	NC_020239	AT	3	6	3474	3479	50 %	50 %	0 %	0 %	449092567
48	NC_020239	CTCC	2	8	3533	3540	0 %	25 %	0 %	75 %	449092567
49	NC_020239	TCA	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092567
50	NC_020239	TTC	2	6	3665	3670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092567
51	NC_020239	GAT	2	6	3743	3748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092567
52	NC_020239	ATC	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092567
53	NC_020239	TAA	2	6	3799	3804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092567
54	NC_020239	CTA	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092567
55	NC_020239	GAA	2	6	3869	3874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092567
56	NC_020239	AAAG	2	8	3929	3936	75 %	0 %	25 %	0 %	449092567
57	NC_020239	TCT	2	6	4270	4275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
58	NC_020239	TTC	2	6	4299	4304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
59	NC_020239	AT	3	6	4318	4323	50 %	50 %	0 %	0 %	449092568
60	NC_020239	CA	3	6	4333	4338	50 %	0 %	0 %	50 %	449092568
61	NC_020239	TAA	2	6	4349	4354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092568
62	NC_020239	A	6	6	4425	4430	100 %	0 %	0 %	0 %	449092568
63	NC_020239	ATTG	2	8	4449	4456	25 %	50 %	25 %	0 %	449092568
64	NC_020239	TTTA	2	8	4464	4471	25 %	75 %	0 %	0 %	449092568
65	NC_020239	TTA	2	6	4501	4506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092568
66	NC_020239	TTA	2	6	4679	4684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092568
67	NC_020239	TTC	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
68	NC_020239	CCA	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449092568
69	NC_020239	A	6	6	4751	4756	100 %	0 %	0 %	0 %	449092568
70	NC_020239	GAG	2	6	4784	4789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449092568
71	NC_020239	CAA	2	6	4803	4808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092568
72	NC_020239	GT	3	6	4809	4814	0 %	50 %	50 %	0 %	449092568
73	NC_020239	TTC	2	6	4860	4865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
74	NC_020239	ATG	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092568
75	NC_020239	AAG	2	6	4890	4895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092568
76	NC_020239	GTA	2	6	4930	4935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092568
77	NC_020239	AGA	3	9	5067	5075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092568
78	NC_020239	GAT	2	6	5098	5103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092568
79	NC_020239	CAT	3	9	5156	5164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092568
80	NC_020239	GATT	2	8	5302	5309	25 %	50 %	25 %	0 %	449092568
81	NC_020239	GAA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092568
82	NC_020239	CTT	2	6	5426	5431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
83	NC_020239	T	6	6	5506	5511	0 %	100 %	0 %	0 %	449092568
84	NC_020239	TA	3	6	5556	5561	50 %	50 %	0 %	0 %	449092568
85	NC_020239	TCA	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092568
86	NC_020239	ATC	2	6	5640	5645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092568
87	NC_020239	ATG	2	6	5655	5660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092568
88	NC_020239	ATA	2	6	5730	5735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092568
89	NC_020239	TCA	3	9	5755	5763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092568
90	NC_020239	ATTCA	2	10	5838	5847	40 %	40 %	0 %	20 %	449092568
91	NC_020239	TCG	2	6	5888	5893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449092568
92	NC_020239	TAA	2	6	5913	5918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092568
93	NC_020239	GTT	2	6	5996	6001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092568
94	NC_020239	CTT	2	6	6005	6010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
95	NC_020239	TAA	2	6	6110	6115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092568
96	NC_020239	TCT	2	6	6125	6130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
97	NC_020239	T	6	6	6138	6143	0 %	100 %	0 %	0 %	449092568
98	NC_020239	TGCT	2	8	6150	6157	0 %	50 %	25 %	25 %	449092568
99	NC_020239	T	6	6	6174	6179	0 %	100 %	0 %	0 %	449092568
100	NC_020239	TTTG	2	8	6184	6191	0 %	75 %	25 %	0 %	449092568
101	NC_020239	TCA	2	6	6197	6202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092568
102	NC_020239	T	6	6	6395	6400	0 %	100 %	0 %	0 %	449092568
103	NC_020239	GTA	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092568
104	NC_020239	TTG	2	6	6582	6587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092568
105	NC_020239	CATA	2	8	6617	6624	50 %	25 %	0 %	25 %	449092568
106	NC_020239	GAA	2	6	6629	6634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092568
107	NC_020239	TAT	2	6	6686	6691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092568
108	NC_020239	TTG	2	6	6705	6710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092568
109	NC_020239	TAA	2	6	6723	6728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092568
110	NC_020239	AGA	2	6	6744	6749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092568
111	NC_020239	TTC	2	6	6831	6836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092568
112	NC_020239	CCAG	2	8	6909	6916	25 %	0 %	25 %	50 %	449092568
113	NC_020239	ATTTT	2	10	7132	7141	20 %	80 %	0 %	0 %	449092569
114	NC_020239	T	6	6	7138	7143	0 %	100 %	0 %	0 %	449092569
115	NC_020239	AGT	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092569
116	NC_020239	AGA	2	6	7253	7258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092569
117	NC_020239	TAA	2	6	7280	7285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092569
118	NC_020239	GAC	2	6	7314	7319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449092569
119	NC_020239	TAA	2	6	7349	7354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092569
120	NC_020239	CTGTA	2	10	7376	7385	20 %	40 %	20 %	20 %	449092569
121	NC_020239	TCGA	2	8	7392	7399	25 %	25 %	25 %	25 %	449092569
122	NC_020239	GTT	2	6	7451	7456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092569
123	NC_020239	CCT	2	6	7459	7464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449092569
124	NC_020239	AAT	2	6	7476	7481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092569
125	NC_020239	TCAT	2	8	7507	7514	25 %	50 %	0 %	25 %	449092569
126	NC_020239	GATA	2	8	7518	7525	50 %	25 %	25 %	0 %	449092569
127	NC_020239	TTA	2	6	7588	7593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092569
128	NC_020239	AC	3	6	7601	7606	50 %	0 %	0 %	50 %	449092569
129	NC_020239	T	6	6	7618	7623	0 %	100 %	0 %	0 %	449092569
130	NC_020239	CAA	2	6	7634	7639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092569
131	NC_020239	TTG	2	6	7704	7709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092569
132	NC_020239	CTA	2	6	7750	7755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092569
133	NC_020239	TAAGA	2	10	7940	7949	60 %	20 %	20 %	0 %	449092569
134	NC_020239	T	7	7	8192	8198	0 %	100 %	0 %	0 %	449092570
135	NC_020239	AGG	2	6	8228	8233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449092570
136	NC_020239	TGA	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092570
137	NC_020239	TAA	2	6	8268	8273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092570
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394	NC_020239	CT	3	6	19359	19364	0 %	50 %	0 %	50 %	449092584
395	NC_020239	AAG	2	6	19429	19434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092585
396	NC_020239	ACT	2	6	19435	19440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092585
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398	NC_020239	T	6	6	19467	19472	0 %	100 %	0 %	0 %	449092585
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400	NC_020239	AAT	2	6	19533	19538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092585
401	NC_020239	AAAT	2	8	19547	19554	75 %	25 %	0 %	0 %	449092585
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